2024年5月，张进和孙昕昊为共同第一作者，张进副教授、李博岩副教授、国果教授为共同通讯作者，在国际期刊《化学信息与建模期刊》（J. Chem. Inf.Model.；IF=5.6，JCR Q1）发表题为《In silicodesign and synthesis of antifungal peptides guided by quantitative antifungal activity》的研究论文。该研究得到了国家自然科学基金项目、贵州省科技计划项目和贵州省自然科学基金项目的支持。

受限于实验验证的效率，新抗菌肽的研发相对缓慢，计算机辅助的虚拟抗菌肽加快了这一过程。本研究以前期我们提出的抗真菌指数（antifungal index）为目标函数，我们开发了一套抗真菌肽（antifungal peptide, AFP）设计方案，antifungipept，包括切片、单点突变和全局优化。通过对100个设计的AFP序列进行切片和单点突变分析，发现随机探索下仅有5.97-20.24%的概率会增强多肽的抗真菌活性，但是使用我们开发的方法能够显著提高这一几率。进一步分析表明，(1)N端截断比C端或两端同时截断更能提高抗真菌活性，(2)在10-60%序列区域引入增强芳香性和疏水性的氨基酸更有效，(3)在多点突变过程中引入丙氨酸、半胱氨酸和苯丙氨酸具有协同增效作用。最终，28个设计的肽中有23个在实验中显示出优异的抗真菌活性（最低抑菌浓度≤5.00μM）。本文提出的新方法已经免费开放在https://antifungipept.chemoinfolab.com.

时间：2024年5月1日

刊物：J. Chem. Inf. Model.

标题：In Silico Design and Synthesis of Antifungal Peptides Guided by Quantitative Antifungal Activity